TAP CCAAT_Dr1 in Panicum virgatum

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Panicinae; Panicum; Panicum sect. Hiantes

Protein source: Phytozome (proteins from primary transcripts)


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules

CCAAT-Dr1_Domain
NF-YB
NF-YC

(Domain names are clickable)



List of proteins (25)

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namename additionClick button to show/hide sequence: Download sequence?
Pavir.Aa00422.1.ppacid=30249415 transcript=Pavir.Aa00422.1 locus=Pavir.Aa00422 ID=Pavir.Aa00422.1.v1.1 annot-version=v1.1
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Pavir.Ab03026.1.ppacid=30235821 transcript=Pavir.Ab03026.1 locus=Pavir.Ab03026 ID=Pavir.Ab03026.1.v1.1 annot-version=v1.1
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Pavir.Fa01360.1.ppacid=30186998 transcript=Pavir.Fa01360.1 locus=Pavir.Fa01360 ID=Pavir.Fa01360.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Fa01512.1.ppacid=30187559 transcript=Pavir.Fa01512.1 locus=Pavir.Fa01512 ID=Pavir.Fa01512.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Fb00481.1.ppacid=30280918 transcript=Pavir.Fb00481.1 locus=Pavir.Fb00481 ID=Pavir.Fb00481.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Fb01052.1.ppacid=30278723 transcript=Pavir.Fb01052.1 locus=Pavir.Fb01052 ID=Pavir.Fb01052.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia03213.1.ppacid=30212037 transcript=Pavir.Ia03213.1 locus=Pavir.Ia03213 ID=Pavir.Ia03213.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ib01924.1.ppacid=30239748 transcript=Pavir.Ib01924.1 locus=Pavir.Ib01924 ID=Pavir.Ib01924.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J02009.1.ppacid=30236682 transcript=Pavir.J02009.1 locus=Pavir.J02009 ID=Pavir.J02009.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J02756.1.ppacid=30247328 transcript=Pavir.J02756.1 locus=Pavir.J02756 ID=Pavir.J02756.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J05081.1.ppacid=30282729 transcript=Pavir.J05081.1 locus=Pavir.J05081 ID=Pavir.J05081.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J18451.1.ppacid=30281809 transcript=Pavir.J18451.1 locus=Pavir.J18451 ID=Pavir.J18451.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J31885.1.ppacid=30195613 transcript=Pavir.J31885.1 locus=Pavir.J31885 ID=Pavir.J31885.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J35907.1.ppacid=30200594 transcript=Pavir.J35907.1 locus=Pavir.J35907 ID=Pavir.J35907.1.v1.1 annot-version=v1.1
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A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

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¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
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